Powstał 19 listopada 2009 roku, powołany Zarządzeniem nr 36 Regionalnego Dyrektora Ochrony Środowiska w Olsztynie z dnia 23 października 2009 r. w sprawie uznania obszaru za rezerwat przyrody „Jezioro Długie”[2]. Celem powołania rezerwatu jest ochrona jedynej dobrze zachowanej w województwie warmińsko-mazurskim populacji reliktowego gatunku poryblinu jeziornego (Isoëtes lacustris) w Jeziorze Długim, utrzymanie istniejących stosunków wodnych oraz ochrona stanowisk chronionych i rzadkich gatunków roślin i zwierząt[1].
